Зрителей ждёт новая стилистика персонажей и локаций, а также появление нового героя: искусственного интеллекта Эвы, которая выступает в качестве помощника и источника данных, так и в роли провокатора изменений. Темы серий «ПинКод 2.0» затрагивают современные области науки: от нанотехнологий и биоинженерии до квантового шифрования. Создателей сериала консультировали ведущие эксперты Сколтеха. Над сезоном «ПинКод 2.0» работала авторская команда «Смешариков» — Алексей Горбунов, Светлана Мардагалимова, Мария Корнилова и другие.
В результате опытов небезызвестного рогатого учёного Смешарики попадают в виртуальную модель своего мира, которая оказывается огромной Метавселенной. Вместе с искусственным интеллектом Эвой друзья решают исследовать новый мир, экспериментируя и изучая технологии будущего. Вскоре выясняется, что Метавселенная хранит много загадок, а выбраться из неё не так-то просто.